发病初期或果实着色开始喷药，可选用80%炭疽福美可湿性粉剂600~800倍液+20%氟硅唑咪鲜胺800倍液或者50%多菌灵可湿性粉剂500倍液+20%氟硅唑咪鲜胺800倍液喷洒防治。每隔七天喷一次，连喷2到3次即可。炭疽病是辣椒上的常发病害，尤其是在辣椒生长中后期，如遇高温潮湿天气，果实受灼伤后，更容易发生。辣椒炭疽病主要危害果实和叶片，也可侵染茎部和果柄。
发病严重的地块与瓜、豆类作物轮作2-3年，多施优质腐熟有机肥，未盖地膜的，要多中耕，少浇水，以提高地温，增强植株抗性。靓果安+沃丰素+大蒜油喷雾，可复配吡唑醚菌酯。发病初期摘除病叶病果，而后喷药，应掌握在雨前雨后喷药，并可采取灌根与喷雾相结合。可喷75%百菌清可湿性粉剂600倍液，或50%施保功可湿性粉剂1500-2500倍液，或57.6%冠菌清干粒剂1000-1200倍液，或68.75%易保水分散性粒剂1000倍液，或50%混杀硫悬浮剂500倍液，或50%多菌灵可湿性粉剂500倍液，或70%代森锰锌可湿性粉剂500倍液，或40%灭病威悬浮剂500倍液，或70%甲基托布津可湿性粉剂800倍液，或1：1：200波尔多液等。也可喷2%武夷菌素200倍液、80%炭疽福美800倍液，每隔7-10天喷1次，连喷2-3次。苗床严格用药，大田必须连续喷药，方可达到良好的防治效果。
