黑星病菌以菌丝体在枝溃疡和芽鳞内或子囊壳在落叶上越冬。子囊孢子到第二年春季成熟,田间分生孢子在6到7月份最多。苹果黑星菌的子囊壳大多在秋冬形成。在培养基上,20C和pH4.5~5.8时生长最适。实体形成后,在紫褐色的予实体层上产牛白霜状担孢子,担孢子陆续成熟,随风雨传播,通过伤口侵入,在木质部定植,然后沿导管上下蔓延。春、秋雨季是病菌侵入的有利时期。树体从感病到出现症状需1~2年时间。发病后,重病树1~2年死亡;轻病树可活十多年,部分病树还可自行恢复健康。该病的发生与果园地势、管理水平及品种密切相关。土壤粘重、排水不良、盐碱过重、树势衰弱的果园发病重;果园管理粗放,伤口不及时保护等均易导致病害发生。大树较幼树易感病。苹果各品种间感病性存在差异。