一般可以撒有机肥、过磷酸钙、氮磷复合肥、氮钾复合肥、三元复合肥等肥料。施用基肥时,将一半有机肥在耕地前均匀撒施在土壤表面,结合耕地翻入地下;另一半在播种时集中沟施,使肥料与土壤混匀后播种。大蒜锈病病菌以夏孢子在种葱、越冬青葱及大蒜的发病组织上越冬,翌年春季3~5月气温回升快、多阴雨,利于病原菌传播和浸染,6~7月蒜头形成或膨大期,病菌可多次再侵染。该病菌喜低温潮湿环境,发病适宜温度10~25℃、相对湿度90%以上。地下水位高、土质黏重、地势低洼、排水不畅、肥料不足、植株生长不良和连作的田块发病重;早春低温多雨、梅雨季节多雨、秋季多雾多雨的年份发病重。大蒜锈病夏孢子萌发温限66~27℃,适宜侵入温度10~23℃。湿度大或有水滴时,9~19℃可侵入;干燥条件下,夏孢子可抵抗-16℃以下低温。田间干葱叶上的夏孢子越冬后仍有25%存活。