姜枯萎病，又称根茎腐烂病，主要危害地下部根茎，造成根茎变褐腐烂，地上部植株枯萎。该病与姜瘟病易于混淆，应注意区分。姜枯萎病根茎变褐而不呈半透明水渍状，挤压病部虽渗出清液但不呈乳白色混浊状，镜检病部可见菌丝和孢子，保湿后患部多长出黄白色菌丝。而姜瘟病根茎多呈半透明水渍状，挤压病部溢出乳白色菌脓，镜检则见大量细菌涌出。
防治方法包括：选地势高燥、排水良好地块种植，并注意田间卫生，及时收集病残株烧埋；重病地块宜实行轮作。提倡施用酵素菌沤制的堆肥和充分腐熟的有机肥，适当增施磷、钾肥，播种前精选姜种，并用50%多菌灵可湿性粉剂300～500倍液浸姜种块1～2小时，捞起拌草木灰下种。发病初期于病株及其四周浇灌50%多菌灵可湿性粉剂500倍液，或10%双效灵水剂200～300倍液，或70%琥·乙膦铝可湿性粉剂300～400倍液，或50%苯菌灵可湿性粉剂1500倍液，隔3～5天1次，连续防治2～3次，以控制病害蔓延。
此外，可与非薯芋类蔬菜轮作3年以上，最好水旱轮作，轮作1年就可收效。选地势较平坦，排水良好地块种植；施足充分腐熟的有机肥，加强肥水管理，并适当增施嘉美海力宝，促进植株健壮生长，雨后及时排除田间积水；收获后及时清除田间病残体。发病初期，可采用下列杀菌剂或配方进行防治：5％丙烯酸·恶霉·甲霜水剂800-1000倍液；80％多·福·福锌可湿性粉剂500-700倍液；3％恶霉·甲霜水剂600-800倍液；5％水杨菌胺可湿性粉剂300-500倍液；70％恶霉灵可湿性粉剂2000倍液；4％嘧啶核苷类抗菌素水剂600-800倍液；兑水灌根，每株灌药液200-300ml，视病情隔7-10天灌1次。