菌核病是一种真菌性病害，主要危害西瓜的茎蔓、叶片和果实。茎的基部被病菌侵染后，初生水渍状病斑，后逐渐扩大成淡褐色的病斑，受侵染后茎蔓的基部软腐或纵裂，导致病茎枯死。叶片受害后叶面可见到许多灰褐色湿腐状的大斑，大斑迅速发展成片时，使叶片腐烂。结瓜后受到病菌侵染，多在幼果的花蒂处出现水渍状斑，扩大后呈湿腐状。
菌核病发生的适宜温度是15℃~20℃，相对湿度达到80%以上时，即大棚内处于低温高湿条件下，最容易引发菌核病的发生。发病的茎、叶和果实上，均可见到白色的絮状菌丝体。瓜面上密生的白色絮状菌丝体，后期病部可见到鼠粪便状的菌核。其菌核可在大棚土壤越夏或越冬，成为下年初次侵染的主要来源。
