大豆常见病害有灰霉病、细菌性斑点病、霜霉病、猝倒病、立枯病、紫斑病、灰斑病、褐斑病、叶斑病、羞萎病、黑点病、锈病、灰星病、菌核病、轮纹病、炭枯病、耙点病、枯萎病、纹枯病、荚枯病、茎枯病、黑痘病、赤霉病、白粉病、疫病、细菌角斑病、细菌斑疹病、花叶病、胞囊线虫病、根结线虫病。危害大豆的主要病虫害有根腐病、立枯病、炭疽病、病毒病、菌核病、锈病、霜霉病、角斑病和地下害虫、红蜘蛛、蚜虫、豆荚螟、大豆食心虫、豆芜菁等。造桥虫种类较多，以银纹夜蛾为多，幼虫为害豆叶，食害嫩尖、花器和幼荚，可吃光叶片造成落花落荚，子粒不饱满，严重影响产量。
大豆根腐病：病株的根部、茎基部出现椭圆形病斑，病斑的颜色多为褐色，发病后期根部会变成黑褐色，防治时可用5%甲霜灵800倍液灌根。大豆灰斑病：发病后，叶片上面会出现红褐色的小斑点，并逐渐扩大成圆形或不规则形病斑，防治时可喷施百菌清、肟菌等药物。
