一般大豆开花结荚期常见的病虫害有大豆螟、盲蝽象、大豆卷叶螟、大豆斜纹夜蛾、蜗牛，病害以霜霉病居多。近年来，点蜂缘蝽成为大豆花期的主要虫害，严重时会导致颗粒无收，主要防治措施是在花期喷布2遍氟虫腈、氟氯·噻虫啉等杀虫剂。其他病害包括灰霉病、叶斑病、黑点病、锈病、灰星病、菌核病等；虫害有斑须蝽、蚜虫、大青叶蝉、金龟甲、菜粉蝶、食心虫、豆小卷叶蛾等。
防治措施包括：
1.中耕培土：防止植株倒伏，保持田间通透性，促进根系发育。
2.及时灌溉：若出现叶片早上正常、中午萎蔫的现象，应及时灌水，采用喷灌方式，灌水30-40毫米。
3.巧施花肥：每亩追施3-5千克尿素、5-10千克过磷酸钙，同时施入5千克硫酸钾。
大豆卷叶螟在本地一年发生2～3代，以8—10月危害最重，幼虫危害叶片造成卷叶，躲在卷叶内咬食叶肉，常吐丝把两叶黏在一起。大豆常见病虫害还包括耙点病、枯萎病、荚枯病、茎枯病、白粉病、疫病、细菌斑点病、双斑荧叶甲、肾毒蛾、斑缘豆粉等。
大豆进入开花期后，病虫害集中发生，主要病虫害有蚜虫、造桥虫、豆天蛾、霜霉病、灰斑、紫斑、炭疽病等。由于大豆开花结荚期正值高温高湿的雨季，霜霉病尤为常见。
