一是选用抗病品种;二是合理施肥,注意氮、磷、钾肥的配合使用;三是合理密植,注意排水,降低田间湿度;四是清除带有病菌;五是化学药剂防治。防治方法包括农业措施和药剂防治。农业措施主要是种植抗病品种,合理密植,合理施肥,多施堆肥或腐熟有机肥,增施磷钾肥,提高植株抗病力,及时浇水抗旱,雨后及时排水,防止湿气滞留。自生麦苗越夏地区,冬小麦秋播前要及时清除掉自生麦,减少秋苗菌源。药剂防治方面,秋苗发病重的地块可药剂拌种,方法同小麦散黑穗病;在秋季或春季,田间发病率3%~5%时,每666.7平方米用20%粉锈宁乳油20~30毫升或15%粉锈宁可湿性粉剂50克,对水50~60千克喷雾,或对水10~15千克低容量喷雾。