花生茎腐病菌春季从花生子叶或幼根侵入植株后，在根颈部形成黄褐色水渍状菌脓，逐渐变成黑褐色病斑，造成根基组织腐烂，最后导致花生整株枯死。在生长季节，如遇连续阴雨天气，田间湿度过大，或遇干燥天气时，花生茎腐病都会不同程度的增加，该病从感病至全株枯死约需10~30d。花生茎腐病的发病部位多在茎基部贴地面处，有时也出现在主茎和侧枝。苗期感病，通常子叶先受害，变黑褐色干腐状，后蔓延到茎基部及地下根颈部，产生黄褐色水渍状不规则形病斑，逐渐绕茎或根颈扩展变成黑褐色病斑。病斑扩展环绕茎基时，维管束变黑褐色，病株萎蔫，幼苗发病3-4天后即变黄褐色枯死。
成株期发病，先在主茎和侧枝的基部产生黄褐色水渍状略凹陷的病斑，后向上下扩展，茎基部变黑褐色，病部以上萎蔫枯死，地下荚果腐烂、脱落。纵剖根颈部，髓部变褐色干腐中空。花生生长中后期，有时仅主茎或侧枝中上部感病枯死，病部以下正常生长，后病部向下扩展导致全枝枯死。潮湿条件下，病部变黑褐色，腐烂，表皮易剥落；干燥时病部表皮呈琥珀色凹陷，紧贴茎上，揭开表皮，内部呈纤维状。病部密生黑色小粒点，即病菌的分生孢子器。拔起病株时易从茎基处折断。
