1、外观不同。红花荠菜的外观呈红色，花朵呈玫瑰红色，而白花荠菜的外观呈白色。
2、功效不同。红花荠菜和白花荠菜均具有清热利湿、凉血散瘀的功效。
3、治疗病症不同。红花荠菜可以用于治疗湿热黄疸、血热吐衄、跌打损伤、风湿痹痛等病症。白花荠菜可以用于治疗水肿、淋证、崩漏、吐血、衄血等病症。
4、禁忌不同。红花荠菜孕妇及月经过多者禁用，以免引起流产或月经过多。同时，孕妇也不宜多吃，以免引起消化道不适症状。白花荠菜有过敏史者禁用，以免引起过敏反应。
5、注意事项不同。红花荠菜不适合脾胃虚寒、腹泻的患者食用，以免加重病情。白花荠菜有轻微刺激性，胃肠道功能较差的患者也不宜食用，以免引起胃肠道不适症状。