粒黑穗病系统侵染，通过种子带菌传播，萌芽的冬孢子从谷子幼苗的胚芽鞘部位侵入幼苗，并随着生长点向上生长，进而到达分化的花序里，最后侵入幼嫩的子房里，破坏子房，形成大量的冬孢子，使谷穗变为黑穗，完成侵染发病过程。谷子黑穗病主要为害穗部，抽穗后表现症状。病穗初为灰绿色，后变为灰色，较短，直立。病粒较健粒略大，颖片破裂、子房壁膜破裂散出黑粉。
防治方法：
1.耕地选种。深耕土地，施足基肥，灌好底墒。种植优良抗病品种，播种前用种衣剂加新高脂膜拌种，可有效避隔离病毒感染，加强呼吸强度，提高种子发芽率。按要求适期播种。
2.田间管理。按照作物需求，及时合理给水、施肥，追肥避免氮肥过多，增施磷、钾肥促使植株生长健壮，提高抗病能力；孕穗期要喷施一次壮穗灵，强化作物生理机能，提高授粉、灌浆质量，增加千粒重。
粟粒黑穗病是茅期侵入的系统性病害。病原菌的厚垣孢子不能在土壤中越冬，主要是脱粒时病穗和健穗混合在一起，使健全籽粒的表面附着大量厚垣孢子，成为第二年的侵染来源。当种子萌发时，附着其上的厚垣孢子也萌发生出原菌丝侵入幼芽。在寄主体内，原菌丝迅速地生长和分枝，侵入生长锥内。而在抗病品种上，侵入的菌丝不产生分枝，很少有菌丝能侵入生长点的分生组织。
黑穗病通过种子和土壤传病，主要是土壤传染，厚垣孢子在土内存活3年左右，在高粱种子露白尖到芽长1—1.5厘米时，侵染幼芽。散黑穗，坚黑穗病菌主要是以厚垣孢子在种子表面附着，带病种子播种后，病菌与种子同时发芽，侵入寄主组织。病菌侵入后，菌丝蔓延到幼苗生长锥，以后随着植株生长点向上生长而伸长，最后在穗部形成冬孢子。
