如发现秧苗出现病症，不要盲目用药，要结合秧苗生长环境条件来防治。以健身防病为主，治疗为辅。通过改善苗床酸碱度、温湿度、补充速效养分(如苗床使用硫酸铵)、促进秧苗生根(喷施生根药剂)、施药控制立枯病病菌(如恶霉灵、甲霜灵、多菌灵等)等几个方面综合考虑，因时、因地、因苗进行防控。预防浓度为65%敌克松可湿性粉剂700倍液(1两药兑水35公斤)；在3叶期出现零星卷叶或无风的早晨出现零星秧苗叶尖端无水珠时，应及时用药抢治，抢治用药浓度为300-500倍液(1两药兑水15-25公斤)进行喷雾。
精心选种与晒种，提高催芽技术，防止种子受伤，提高种子生命力和抗病力。适期播种，播种密度不要过大。苗床管理要做好防寒、保温、通风、练苗等环节的工作，提高幼苗抗病力，防止和减轻立枯病、恶苗病的发生。加强田间管理，要做好防寒、保温、通风、炼苗环节，做到前保(出苗前保温)、中控(出苗后至3叶期控温)、后炼(3叶期至插秧前调温)，提倡稀插早育苗，控制温湿度不徒长。3叶期后白天应揭膜通风锻炼，夜间如果无霜冻最好也要揭膜使之经受低温，这样可以培育出抗寒力强的壮秧。防治水稻立枯病，崔芽前做好晒种，种子消毒工作，崔好芽播种，秧田施好肥开好三沟，地膜管理要细致，发现发病及时施药防治。
