褐条病病原以菌丝体在病株或遗落田间的病残体上越冬,成为第2年的初次侵染源。当环境适宜时产生大量分生孢子借气流传播。落在蔗叶上的孢子遇到雨水或露水时萌发长出芽管。病斑上不断产生分生孢子靠风雨传播进行再侵染。谷子苗期、成株期都可被侵染,但以生育后期发病较多。分生孢子随风雨传播,在一个生长季节中有多次再侵染。多雨年份和低湿田块多见。水稻细菌性褐条病可由种子、田间杂草和土壤带菌体作为初侵染来源。燕麦假单胞菌主要存在于种子的颖壳与果皮之间或深入种子中。有病种子播种后,病原细菌会在种子萌芽时迅速增加,并侵人幼苗,使秧苗发病。水稻在抽穗开花时若遇侵染,病菌会侵入种子,成为下一季的侵染源;病株残体亦可传病。病菌主要在病残体或病种子上越冬,成为初浸染源,病菌借水流、暴风雨传播蔓延,多从谷子植株表面伤口或自然孔口侵入。拔节期至抽穗期连续阴天寡照,高温多雨有利于发病;过度密植,株间通风透光不好有利于该病发生;重茬地、低洼地发病重;虫害发生严重的地块该病发生重。高温、高湿、阴雨有利于发病。偏施氮肥,发病重。高秆品种较矮秆品种抗病。