菜豆枯萎病是由真菌引起的一种病害，通常在花期开始发病。病害由茎基迅速向上发展，导致茎一侧或全茎变为暗褐色并凹陷，茎维管束变色。病叶叶脉变褐，叶肉发黄，最终全叶干枯或脱落。病菌通过流水、雨水、农具、土壤、肥料等传播。
病株各部位均可受害。病叶初呈淡绿色，逐渐变为浅黄色，叶缘尤其是叶尖部分常变黑焦枯。叶片自下向上逐渐变黄枯萎，病叶常扭折、弯曲，干枯脱落。病株茎基部有黑褐色病斑，稍凹陷，潮湿时常产生粉红色霉层，即病菌的分生孢子座。茎基部病斑逐渐向上发展，致使茎上部分嫩尖倾斜或下垂，最后整个植株枯死。
根系受害，侧根和主根上均产生褐色至黑褐色条纹，逐渐发展，可导致主根变黑，皮层腐烂，须根全部坏死并消失。病株根系弱小，极易拔出。剖开病茎，可见维管束变黑。菜豆发病后，下部叶片先萎蔫、变黄，然后逐渐向上扩展，叶脉变褐，以后全株叶片枯黄脱落。病株根系发育不好，侧根少，变褐腐烂，容易拔起。剖视染病根、茎，可见维管束呈褐色。花期以后发病，结荚显著减少，荚背及腹部缝合线也呈黄褐色。