辣椒青枯病是由青枯假单细胞杆菌引起的细菌性病害，主要发生在作物根部的伤口。病菌侵入作物后进入维管束，通过增殖堵塞输导系统，使水分不能进入茎叶而引起青枯。病菌喜高温高湿环境，适宜发病的温度范围为10-40℃，最适发病环境为土壤温度20-25℃，土壤pH6.6。最适感病的生育期为座果期，发病潜育期10-20天，病菌致死温度为52℃经10分钟。
植株发病时，顶部叶片白天枯萎，阴天或早晚恢复，2-3天后叶片保持绿色但全株枯萎。切开病茎，导管呈褐色，切口浸水后流出白色混浊的菌液。当土温达到20-25℃，气温30-37℃，土壤水分质量分数达25%以上时发病严重。病菌主要随病残体在土中越冬，翌年春借助雨水、灌溉水传播，从伤口侵入，经潜伏和繁殖，至成株期遇高温高湿条件向上扩展，在维管束导管内繁殖，堵塞导管或使细胞中毒，导致叶片萎蔫。病菌也可进入邻近薄壁细胞，使茎上出现水浸状不规则病斑。土壤温度20℃时出现发病中心，25℃时出现发病高峰。久雨或大雨后转晴，气温急剧升高，病情加重。
病原菌为青枯假单细胞杆菌，短杆状，单胞，两端圆，单生或双生，大小(0.9-2.0)微米×(0.5-0.8)微米，极生鞭毛1-3根。在琼脂培养基上菌落圆形或不正形，稍隆起，污白色或暗色至黑褐色，平滑具亮光。革兰氏染色阴性，能利用多种糖产生酸，不能液化明胶，能使硝酸盐还原。
