辣椒根腐病主要危害辣椒根茎部及维管束。发病初期，病株的枝叶特别是顶部叶片出现白天萎蔫、早晚恢复的现象。如果病情持续发展，顶部叶片无法恢复，萎蔫症状向中下部扩散，浇水也无法减轻症状。再经2-3天，全株叶片全部萎蔫，但叶片仍呈绿色。发病后期，病株的根茎部呈淡褐色或深褐色腐烂，极易剥离，露出木质部，可见维管束变褐色；潮湿时可见病部长出白色至粉红色黏质物，即病菌的分生孢子梗及分生孢子。辣椒根腐病是由腐皮镰孢霉等引起的病害，发病严重时，植株生长发育不良，株型矮小，根系腐烂，最后植株枯死但叶片仍呈绿色。
红蜘蛛的幼虫、若虫、成虫均群集在叶背面吸取汁液，然后逐渐向上扩展。受害叶先形成白色小斑点，后褪变为黄白色，严重时变锈褐色，造成叶片脱落和植株枯死。果实受害则果皮变粗，并形成针孔状褐色斑点，影响果实品质。
