硼在植物体内促进花粉形成、花粉管萌发，减少小麦花而不实、棉花蕾而不花和花粉畸形等情况，避免花、蕾易脱落，受精不正常，果实种子不充实等。同时，硼能促进作物细胞伸长和细胞分裂，有利于作物根系的生长和伸长，避免出现生长点坏死，叶片畸形、增厚、果皮木栓化。此外，硼参与作物体内碳水化合物的运输和代谢，增加作物果实糖的成分，提高坐果率，避免出现影响果实发育不良、畸形，落果等现象。
小麦孕穗期缺硼，影响雌蕊、雄蕊的正常发育，使穗粒数减少，空壳增加，千粒重下降。开花期缺硼，会造成花药瘦小、空秕不开裂、不散粉、花粉少或畸形，有时无花粉，子房横向膨大，颖壳前期不闭合，后期枯萎，生育期推迟。抽穗困难，穗常呈畸形，造成空秕穗。降低了小麦的穗粒数和千粒重，使产量降低且品质下降。有时会一边抽穗一边分蘖，有时不能抽穗或者只开花表现为“穗而不实”。后期叶片会出现“灰褐色霉斑”。小麦严重缺硼时，会导致根系生长受阻，粗、短而不平，生长前期植株矮小，分蘖不正常，上部新叶“叶色暗绿”或呈紫色，叶片变小，稍硬，顶端分生组织死亡，形成“顶枯”，叶梢会呈“紫褐色”。
