1.选用无病种薯。2.用化学保护剂处理切块种薯，注意切刀消毒。3.合理轮作，避免在发生过枯萎病的田块里栽培马铃薯。马铃薯应与禾谷类作物或者绿肥植物进行3-4年的轮作。4.清洁田园，施用有机肥。收获后将一切残枝烂叶清除干净，清除感病块茎和秧苗，施用腐熟的有机肥，加强田间水肥管理，可以减轻病害发生。5.药剂防治：发病初期喷50%多菌灵可湿性粉剂600倍液，或者50%苯菌灵可湿性粉剂1000倍液。也可使用克枯丹600-1200倍液喷雾控制病情，再用噁霉灵、30%甲霜·噁霉灵等药剂进行防治。将多菌灵或五氯硝基苯等土壤消毒剂，施用在种植带上，可减轻发病几率。
对于马铃薯枯萎病的防治首先就要从土壤方面入手，改善土壤质量，可以在一块土地上进行交叉种植。也就是说，假如以4年为一个周期计算，在每一个周期进行不同作物的种植与培育。比如，在一块土地上，种植马铃薯已经有四年，在第五年的时候，就可以改种玉米这类禾本作物，不仅能够最大程度的改善土壤质量，并且可以丰富土壤中有益物质的含量，促进农作物的有效吸收。从而在有效利用土壤资源的基础上，充分有效的改善马铃薯枯萎病的问题。
在基施有机肥时，农家肥要充分腐熟后再施用，以免引虫入土虫伤根部，有机肥要施优质的，以免带菌，引发枯萎病发生。加强水分管理，温度在20℃以上时，要保持薯田土壤湿润，如果过于干旱，也会引起枯萎病发生，同时要做好防涝，水分太多土壤过黏，湿度太高透气性差，也会引起马铃薯枯萎病发生。农药防治，马铃薯枯萎病宜防难治，及时发现及时防治，对发病初期的病株，可用70%的甲基托布津1000倍液，或25%的百菌清500倍液进行灌根处理，一周一次，可连灌数次，对病情较重植株应及时拔除，以防传染扩散。必要时浇灌12.5%增效多菌灵浓可溶剂300倍液。
