小麦最常见的病害是小麦白粉病。特别是这两年，因播种量大，小麦进入孕穗期以后，田间小麦稠密，造成透光差，通风差，更加剧了小麦白粉病的发生。小麦条锈病是小麦锈病之一。小麦锈病俗称“黄疸病”，分条锈病、秆锈病、叶锈病3种，是中国小麦生产上分布广、传播快，危害面积大的重要病害。其中以小麦条锈病发生最为普遍且严重，主要发生在河北、河南、陕西、山东、山西、甘肃、四川、湖北、云南、青海、新疆等地。
气流传播病害主要有小麦锈病、白粉病、赤霉病等；土传病害主要有小麦纹枯病、全蚀病、根腐病等；种传性病害主要有小麦黑穗病等；病毒性病害主要有小麦丛矮病、小麦黄矮病等。
