玉米黑穗病是苗期侵染的系统性病害,一般到穗期才出现典型症状。雄穗受害多数病穗仍保持原来的穗形,部分小花受害,花器变形,颖片增长呈叶片状,不能形成雄蕊,小花基部膨大形成菌瘿,外包白膜,破裂后散出黑粉(冬孢子)。发病重的整个花序被破坏变成黑穗。病果穗较粗短,基部膨大,不抽花丝,苞叶叶舌长而肥大,大多数除苞叶外全部果穗被破坏变成菌瘿,成熟时苞叶开裂散出黑粉。病株大多矮小,只有健株的1/3-2/5,偶尔也在剑叶中脉发生条状黑粉堆。玉米丝黑穗病会侵害玉米雌穗和雄穗。通常于玉米出穗以后显现症状,但许多自交系或杂交种的一些病株在苗期症状就很明显。一种症状是在第4-5叶片上生1-4条明显的黄白色条纹,另一种是植株茎秆下粗上细,叶色暗绿,叶片变硬,上挺,株形如笋状。玉米丝黑穗病的典型病症是雄性花器变形,雄花基部膨大,内为一包黑粉,不能形成雄穗。雌穗受害果穗变短,基部粗大,除苞叶外,整个果穗为一包黑粉和散乱的丝状物,严重影响玉米产量。