一般在发病初期用药，玉米穗腐病、纹枯病用井冈霉素，玉米锈病用粉锈宁，效果较好。玉米大班病、小斑病、灰斑病目前未见特效药，但用甲基托布津、百菌清防治有一定效果。玉米螟防治：抽雄前采用1.5%的辛硫磷颗粒剂或呋喃丹，丢放于喇叭口内；穗期用90%的敌百虫800―1000倍液，滴于雌穗顶部，效果较好；地下害虫主要采用毒饵诱杀，用辛硫磷或敌百虫拌细土撒施。
玉米品种的选择上要选抗病耐病能力较强的。在播种前要做灭茬处理，最好进行秸秆粉碎后将整块土地全部深翻一遍，这样可以大大降低土壤中的病虫寄生率。尽可能地进行生物防治，比如引进杀虫灯、赤眼蜂等。做好田间护理，及时将杂草拔掉。
