玉米苗期主要虫害包括地方害虫（金针虫、蝼蛄、蛴螬、地老虎等）、二点委夜蛾、红蜘蛛、蚜虫、粘虫、草地贪夜蛾等。此外，叶蝉、盲蝽蟓、蓟马、叶甲、黑麦秆蝇、旋心虫等也是苗期常见的害虫，如果不加以防治，可能会大面积发生。
防治地下害虫的方法包括浇灌药液，每公顷使用50%辛硫磷乳油7.5千克，加水750千克顺垄浇灌。对于黏虫，可使用50%辛硫磷乳剂3000倍液喷雾；蓟马则可用40%乐果乳剂或50%敌敌畏乳剂各稀释1500倍喷雾。喷洒乐果、菊酯类农药还可杀死蚜虫、灰飞虱等传毒昆虫，防止病毒病的发生。在蓟马、灰飞虱发生盛期，可选用10%吡虫啉可湿性粉剂3000倍液喷雾防治。
