带菌种子和病株残体提供初侵染菌源。接种试验表明，谷瘟病菌能侵染青狗尾草，而马唐等多种禾本科植物则不被侵染，田间多数禾本科作物和杂草不能提供越冬菌源。谷子病株产生新一代分生孢子，随风雨传播，进行再侵染。在华北地区，每年发生5～8代，8月份是发病高峰期。在吉林省，叶瘟在7月中旬开始发生，7月末至8月上旬为发病高峰；穗颈瘟在8月上旬开始显症，8月下旬停止发展。在叶片里潜育期约7-10天或短到5-6天。当寄主组织逐渐死亡时就出现界限分明的病斑，并从气孔抽出分生孢子梗和产生分生孢子进行再侵染。在华北地区每年产生5-8代分生孢子。常年以8月份发病率最高，以后随气温下降发病逐渐减少。
