病菌以菌丝和分生孢子在病残株上越冬，也可在病薯上窖内越冬，成为第二年的侵染源。土壤亦是侵染源之一。在病残株上，病菌即使在-35~-45℃下都可以存活，表面的分生孢子在-27℃下只能存活5天。病菌在土内15~20厘米处一年很少存活，土深10~15厘米病菌生存亦受影响，而在土表的病菌则仍能保持其生活力。第二年分生孢子经风雨传播，从气孔、伤口或直接侵入。一般在马铃薯下部叶片先开始发生，经反复侵染逐渐蔓延到顶部，在开花前2~3周可出现症状，但一般蔓延很慢，到生长后期才蔓延快。
分生孢子侵染的温度5～26℃，最适温度12～16℃，发病的最适温度24～30℃。潜育期长短亦与温度有关，25℃时仅2天，10℃和33℃分别延长为8天、7天，35℃以上病害不能发展。分生孢子发芽要求80％以上湿度，最好有水滴存在。在适温下仅35～45分钟可发芽，温度低（6℃）或高（34℃）发芽延长至1～2小时，但当相对湿度降低到55％发芽减少，侵染率也低。马铃薯早疫病的病菌是在病残体或带病薯块上越冬，翌年种薯发芽病菌即开始侵染。病苗出土后，其上产生的分生孢子借风、雨传播，进行多次再侵染使病害蔓延扩大。因此，在7~8月雨季温湿度合适时易发病，如果这期间雨水多、雾多或露水重，暴风雨次数多，发病重。老叶片易发病。
