小麦赤霉病是一种多发生于温暖潮湿环境的真菌性病害，从苗期到成熟期都可能发生，其中穗腐是危害最严重的类型。病害症状多样性，包括苗腐、茎基腐、秆腐和穗腐。受害麦苗生长衰弱甚至枯死，而受害籽粒则皱缩干瘪，变成灰白色或紫红色。在湿度大时，各种病部均可产生粉红色霉层。
苗病由种子带菌或土壤中病残体侵染所致。先是芽变褐，然后根冠腐烂。轻者病苗黄瘦，重者幼苗死亡。手拔病株易自腐烂处拉断，断口褐色，带有黏性的腐烂组织。
茎基腐：麦株基部组织受害后变褐腐烂，致全株枯死。
秆腐：多发生在穗下第一、二节，初在叶鞘上出现水渍状褪绿斑，后扩展为淡褐色至红褐色不规则形斑，病斑也可向茎内扩展。病情严重时，造成病部以上枯黄，有时不能抽穗或抽出枯黄穗。
穗腐：发生初期，在小穗和颖片上出现小的水渍状淡褐色病斑，后逐渐扩大至整个小穗，小穗枯黄。湿度大时，病斑处产生粉红色胶状霉层，后期其上密生小黑点，即子囊壳。后扩展至穗轴，病部枯褐，使被害部以上小穗形成枯白穗。严重时可导致整个小穗或穗子全部枯死，呈灰褐色。田间潮湿时，病部可产生粉红色胶质霉层；空气干燥时则不产生霉层，直接表现为枯死状态。到发病后期，可在穗部观察到黑色的小颗粒（这是病原菌的子囊壳）。同时，受病害影响的小穗内的籽粒会变得皱缩、干瘪，并可能被白色至粉红色的霉菌覆盖。
如遇连续降雨天气超过两天，小麦田间湿度偏大，这给小麦赤霉病的发生提供了有利的条件，甚至造成部分麦田减产和严重影响小麦品质。小麦赤霉病是一种典型的气候型病害，在小麦扬花灌浆期遇到阴雨天气，空气中又有大量病菌（子囊孢子）时，赤霉病就有可能发生。
