草鱼出血病的初期症状表现为食欲减退，体色发黑，尤其是头部，尾鳍边缘可能呈现褐色，背部两侧有时出现浅白色带。随着病情发展，病鱼出现不同部位的出血症状，肌肉呈现点状或斑块状出血，严重时全身肌肉出血呈现鲜红色。鳃丝通常暗黑微带红色，口腔、下颚、头顶或眼周围充血，严重时鳃盖和鳍条周围也会充血。皮下和肌肉有出血现象，内脏器官如肠道、肠系膜及周围脂肪、鳔、胆囊、肝、脾、肾等也出现出血点或血丝。病鱼可能还伴有水霉病和肝脏综合症。全身性出血是本病的重要症状，严重时鱼鳃因贫血呈现灰白色，血色变淡；肠壁充血但保持韧性，肠内无食物。根据症状的不同，本病可分为红肌肉型、红鳍红鳃盖型和肠炎型。