番茄软腐病主要危害茎部和果实。茎部多从整枝伤口处开始,继而向内部延伸,最后髓部腐烂,有恶臭,失水后,病茎中空。病茎维管束完整,不受侵染。果实被害果皮完整,内部果肉溃烂,汁液外溢,有恶臭。茎部染病,主要从整枝打杈造成的伤口侵染,严重的髓部腐烂,失水后病组织干缩中空,病部维管束完整,病茎上端枝叶萎蔫,叶色变黄。该病多自果实的虫伤口、日烧伤处先发病,病部组织软化腐烂,发展迅速,常扩及半个果实至整个果实。最后病果整个果肉腐烂成浆,只外边一层果皮兜着,丧失果形,腐汁具有臭味。茎杆受害症状主要发生在棚室中,植株中、下部的茎杆、枝条上,病茎部灰褐色、长条形斑,表皮湿腐,微束完整无损,髓部呈褐色,腐烂,有异味,病株萎蔫死亡。防治方法是加强田间管理,整枝抹芽宜早,及时整枝、打杈;选择在晴好天气进行植株管理,促进伤口尽快愈合,避免阴雨天或露水未干之前整枝,发现病果、病株及时清理并销毁;及时防治蛀果害虫,减少虫伤。种子处理可选用无病种子,或用55℃温水浸种20分钟灭菌。