在番茄幼果和青果时，脐部形成水渍状，暗绿色病斑，逐渐变成褐色或黑色，严重时，病斑扩大至半个果面，病部果肉崩溃收缩。在湿润条件下，因病生菌寄生，形成黑色或红色霉状物。以青果期至着色期前最易发病，发病初始在幼果脐部、花器残余部位及其附近产生水浸状斑，暗绿色，后扩大为暗褐色大斑，有时扩展到半个果实。当病部深入到果肉内部时，果肉组织呈干腐状收缩，较坚硬，被害部分外部呈扁平状，表面皱缩，病果一般不腐烂。最初表现为脐部出现水浸状病斑，后逐渐扩大，致使果实顶部凹陷、变褐；病斑通常直径1cm，严重时扩展到小半个果实。在干燥时病部为革质，遇到潮湿条件，表面生出各种霉层，常为白色、粉色及黑色。
加强番茄的田间管理，采用地膜覆盖栽培可提高地温，促使根系发育，增强植株吸水能力。增施钙肥，在番茄移栽前，对脐腐病发生重的酸性土壤中，亩施石灰50-75千克，均匀撒入地面，进行翻耙混土，效果特别显著。进行根外追肥，在花期喷施1%磷酸钙或0.1%氯化钙或脐腐灵，可以大大增强青果的抗病能力。采用根外追施钙肥技术。
