马铃薯Y病毒为单链RNA,病毒粒体线状,795纳米×12纳米,钝化温度50-65℃,稀释限点为10-4-10-5,在室温下存活两周。病叶经快速干燥后保存在干燥条件下,病毒可存活几个月到1年。已知至少有3个株系。病株叶片产生轻微的褪绿斑驳花叶,严重时叶片上花叶斑驳浓淡相间、不规则交替,叶脉上及叶脉间也出现面积不一的斑驳。发病初期,顶部叶片产生斑驳花叶或枯斑,以后叶片两面都可形成明显的黑色坏死斑,并可由叶脉坏死蔓延到叶柄、主茎,形成褐色条斑,使叶片坏死干枯,植株萎蔫。不同品种反应不同,如植株矮小,节间缩短,叶片呈普通花叶状,叶、茎变脆。带毒种薯长出的植株可严重矮化皱缩或出现条纹花叶状,也可隐症。病株薯块变小。