辣椒炭疽病借助风雨传播，高温多雨、积水过多、长势衰弱、密度过大、氮肥过多都会加重病害发生。多用有机肥菌肥，增施磷钾肥，提高抗病能力，促进根系生长。可用药剂苯醚甲环唑、咪鲜胺兑水均匀喷雾，7-10天喷一次。辣椒炭疽病有3种，即黑色炭疽病、黑点炭疽病和红色炭疽病，其中黑色炭疽病发生普遍，黑点炭疽病仅部分地区发生，红色炭疽病发生较少。叶片染病多发生在老熟叶片上，产生近圆形的褐色病斑，亦产生轮状排列的黑色小粒点，严重时可引致落叶。可以用咪鲜胺锰盐、腐霉利、二氰蒽醌、苯醚甲环唑.嘧菌酯、阿陀(啶氧菌酯)加叶面肥喷雾防治，间隔5天再喷雾一次。
辣椒细菌性叶斑病由细菌感染引起，叶片先出现点状病斑，水浸状、不规则形、褪绿，后发展为褐色至铁锈色，病部薄膜状。干燥时病斑呈铁锈色，病斑质脆，有的穿孔。可用中生菌素、乙蒜素、多抗霉素、农用链霉素、辛菌胺乙酸盐、氯溴异氰脲酸、春雷王铜、噻菌铜、噻森铜、喹啉铜、氢氧化铜、氧化亚铜、氧氯化铜、甲霜铜、络氨铜、松脂酸铜等进行防治。
蚜虫是蔬菜发生量最大、危害期最长的害虫。随着农药施用量的逐年加大，蚜虫抗药性逐年增强，因此采用无公害治蚜可提高防治效果。
