菠菜灰霉病的防治方法主要包括以下几点：
1.选用耐湿抗性品种，如迟乌叶、东湖菠菜等。
2.加强田间管理，避免低温高湿条件出现。保护地栽培时，要调节小气候，采用生态防治，阴雨天及时短时间通风降湿，入冬季节低温晴天条件下，封闭大棚四周风口，提升棚温。
3.合理施肥浇水，要小水勤浇，忌大水漫灌，雨后及时排水，浇水后还要及时排湿，降低空气湿度，控制发病条件出现。
4.菠菜收获后及时清除病残体，集中烧毁或深埋，减少再浸染源。
5.定植后发现零星病株即开始喷洒65%甲霉灵(硫菌霉威)可湿性粉剂1500倍液或50%速克灵可湿性粉剂1500～2000倍液或50%扑海因可湿性粉剂、50%农利灵可湿性粉剂1000～1500倍液、50%扑海因可湿性粉剂1000倍液加90%三乙膦酸铝(乙磷铝)可湿性粉剂800倍液、45%特克多悬浮剂4000倍液、50%混杀硫悬浮剂600倍液、50%的多菌灵胶悬剂800倍液或75%的百菌清可湿性粉剂600～800倍液喷雾防治。隔7～10天一次，连续喷洒2～3次。采收前3天停止用药。
6.阴雨天气来临前的晴天要及时喷洒保护性杀菌剂，一般用品润600倍液或甲基托布津1000倍液进行喷雾保护。保护地栽培阴雨天气时，可傍晚施速克灵烟剂，每667平方米每次250g，点燃后密闭通风口，次日早晨通风，连续2～3次效果较好。
7.及时摘除病叶和中下部老叶，以利通风透光。菠菜收获后及时清理病残体，清洁田园，集中深埋处理，减少再浸染源。
8.发现零星病株即开始喷洒70%甲基托布津可湿性粉剂800倍液、75%好速净可湿性粉剂800倍液、50%速克灵可湿性粉剂1500倍液、50%多菌灵可湿性粉剂600倍液、50%农利灵可湿性粉剂1000倍液或40%灰清悬浮剂500倍液，连喷2～3次。但阴天不宜喷药，喷药防治应选择在晴天上午。同时，由于菠菜植株矮，中下部叶片多匍匐于地，往叶片背面喷药困难，喷药防治时最好加入少量渗透剂，提高防效。
