幼芽或幼根变褐色，病芽扭曲、腐烂而死。在种子或芽基部生有霉层。针腐多发生于幼苗立针期到2叶期，病苗心叶枯黄，叶片不展开，基部变褐，有时叶鞘上生有褐斑，病根也逐渐变为黄褐色。种子与幼苗基部交界处生有霉层，茎基软弱，易折断，育苗床中幼苗常成簇、成片发生与死亡。黄枯、青枯多发生于幼苗2.5叶期前后，病苗叶尖不吐水，叶色枯黄、萎蔫。
水稻立枯病主要有4种类型：芽腐型发生在幼芽出土前，在种子或芽基部有白色或粉色霉层。基腐型发生在立针到2叶期，病苗心叶枯黄，基部变褐变软，根坏死，茎基腐烂易断，秧田中成片发生。黄枯型发生在3叶期前后，病苗叶尖不吐水，心叶卷曲逐渐萎蔫枯黄，根变褐、茎基部变褐、甚至软腐，拔苗时易连根拔起或心叶易折断，在苗床中间部分成簇成片发生。青枯型发生在3叶期前后，病苗叶尖先不吐水，后成片打卷青死，心叶或上部叶卷成绺叶状，可连根拔起。
青枯病亦属立枯病的一种表现形式，多数是由于叶面蒸发量大于根系水分供应量而引起的生理性病害，后由真菌侵染而表现黄枯。田间症状主要表现为出苗后秧苗枯萎，容易拔断，茎基部腐烂，有烂梨味，发病较重的整片死亡，病株基部多长有赤色霉状物。
