发病轻重与降雨有关，雨季早，降雨多、气温高的年份发病早而严重。地势低洼，排水不良，行间间种高粱、玉米或西瓜、蔬菜的发病轻重。地势低洼，行间郁闭发病重，雨季早，降雨多，气温高的年份发病重。由于枣园长期积水会致使枣果脱落，根系大量死亡，枣锈病加重。由于枣园土壤肥力贫瘠、或枣树势衰弱、或枣树偏施氮肥、或枣园内锈壁虱危害重等均易引起枣锈病的发生。枣锈病菌主要以病原孢子在落叶上越冬，也可以多年生菌丝在病芽中越冬，借风力、雨水传播，成为翌年的初侵染来源。通常于7月中下旬开始发病，8月上中旬至9月初出现大量夏孢子堆，不断进行再侵染，发病达到高峰。枣园内及野生酸枣上的越冬病叶中，有一部分夏孢子堆具有越冬致病能力，作为次年的初次侵染来源。枣锈病的流行与7-8月的降雨量及枣林内的湿度呈正相关。一般8月初开始发病，9月初发病最盛，并开始落叶。