玉米丝黑穗病主要为害雌、雄穗,但苗期已表现病状,随着叶龄增加,特征愈明显,确诊率愈高。可结合间苗、定苗及中耕除草等拨除病苗、可疑苗,拨节至抽穗期病菌黑粉末散落前拨除病株,抽雄后继续拨除,彻底扫残。拨除的病株要深埋、烧毁,不要在田间随意丢放。主要是种子带菌和土壤带菌。播种前,用戊唑醇、氟唑环菌胺悬浮进行种子包衣,还可兼防玉米丝黑穗病。玉米出苗前,可用多菌灵、克菌丹喷洒地表进行预防。在玉米抽雄前,用苯醚甲环唑悬浮剂1喷雾,每隔7~10天喷1次,连喷2~3次。在花期、灌浆期,加强对玉米螟等玉米穗部害虫的防治,以减少利于病菌入侵的虫害伤口。2—3年轮作倒茬。在玉米即将抽穗时,用1%的波尔多液喷雾。在玉米抽穗前10天左右用50%福美双可湿性粉剂500~800倍喷雾。