西瓜疫病是一种土传病害，病原菌以菌丝体、卵孢子及厚垣孢子的形式在土壤和粪肥中越冬。在第二年条件适宜时，病原菌会形成孢子囊，并通过风雨和灌溉水传播。寄主被感染后，在有水的环境中，4～5小时内即可产生大量孢子囊和游动孢子。在25～30摄氏度的温度下，病害的潜育期仅为24小时。病斑上新产生的孢子囊及其萌发后的游动孢子通过气流传播，实现再侵染，导致病害迅速扩散。
病害的发生受温度影响，发病温度范围为5～37℃，最佳发病温度为20～30℃。雨季和高温高湿的条件下，病害发展迅速。此外，排水不良、种植过密、茎叶茂密或通风不良都会加重病害的发生。
