首先选用抗病品种，注意轮作倒茬。选择保水力强、耕层深厚的沙壤土种植，均匀灌水，结果后连续喷2至3次磷酸二氢钾。在叶面上喷施1%过磷酸钙或0.1%氯化钙，初花期开始，隔15天进行一次，连续进行2次。缺钙是主要原因，叶面喷施乙二醇钙、煮沸钙、硝酸钙等，7天间隔连续喷施2~3次。应提前喷钙肥，预防为主。
辣椒脐腐病主要发生在果实脐部附近。受害的辣椒果实表皮发黑，逐渐形成水浸状病斑，病斑中部呈革质化，扁平状，逐渐转化成暗褐色下陷，失水后收缩成皮囊状。有的果实在病健交界处开始变红，提前成熟。发生严重时病斑因湿度大被杂菌侵染，生有深褐色霉状物，果肉腐烂。
