选择地势高燥、水源方便、旱能浇、涝能排、前茬未种过瓜类蔬菜的地块做育苗床，选用无病新土做床土。使用旧苗床时，应进行床土消毒。按每平方米用托布津、苯来特或苯胼咪唑5克和50倍干土拌匀，撒在床面上。也可用五氯硝基苯与福美双各25克，掺半潮湿细土50千克拌成药土，在播种时下垫上盖，有一定保苗效果。施用的肥要腐熟、均匀，床面要平，无大土粒。播种前早覆盖，提高床温到20℃以上。
南瓜种子要进行消毒处理，催芽时间不宜过长，播种不宜过密。苗床温度应控制在20~30℃，地温保持在16℃以上。注意提高地温，降低土壤湿度。猝倒病俗称“倒苗”、“霉根”、“小脚瘟”，主要由瓜果腐霉属鞭毛菌亚门真菌侵染所致。刺腐霉及疫霉属的一些种也能引起发病。病菌寄主范围很广，严重时可引起成片死苗。
苗床要选在背风、向阳、高燥的地方，选无病土做营养土；营养土中的有机肥要充分腐熟。选用抗病、包衣的种子，如未包衣，则用拌种剂或浸种剂灭菌后，才催芽、播种。齐苗后，严格控制温度、湿度及光照；可结合练苗，揭膜、通风、排湿。播种后用药土做覆盖土，发病后用药土围根或喷药；及时检查，发现病苗立即拔除。
齐苗后白天苗床或棚温保持25～30℃，夜间保持10～15℃，防止寒流侵袭。苗床或棚室湿度不宜过高，连阴雨或雨雪天气或床土不干应少浇水或不浇水，必需浇水时可用喷壶轻浇以免湿度过高。当塑料膜或玻璃及秧苗叶片上有水珠凝结时，要及时通风或撤些草木灰降湿，如能撒施药土围根，效果最好。选用无滴膜盖棚室，改善光照条件，增加光照强度，以利光合作用提高幼苗抗病力。
在播种前应将种子消毒处理，播种不宜过密，控制好地温和土壤湿度，在发病初期，使用硫酸铜搭配碳酸铵以1：2的比例进行混合用药喷，每7至10天喷施一次。南瓜猝倒病的药剂防治发病初期喷淋72.2％普力克水剂400倍液，每平方米喷淋对好的药液2-3升，或15％恶毒灵(土菌消)水剂450倍液，或12％绿如乳铜乳油600倍液，每平方米3升。在发病初期也可用25%甲霜灵可湿性粉剂800倍液、或64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液、或75%百菌清可湿性粉剂600倍液、或40%乙磷铝可湿性粉剂200倍液、或72.2%普力克水剂400倍液，每7~10天1次，连喷2~3次。
