苗期预防辣椒病毒病、疫病。苗床集中，管理方便，预防省工、省力、省药且效果好。苗期需重视蚜虫防治。在防治传毒昆虫的基础上，从5叶期开始用20%病毒A可溶性粉剂800倍液喷撒椒苗，间隔10—15天再喷1次，有效预防病毒病。移栽前2—5天喷1次阿米西达悬浮剂1500倍或64%杀毒钒可湿性粉剂500倍液防治疫病，带药移栽，可预防疫病、立枯病等，确保健苗移栽，减少病害传入大田。
大田病害预防。移栽后3—5天喷1次阿米西达悬浮剂1500倍或64%杀毒钒可湿性粉剂500倍液防治疫病，有效预防死苗。历年重病连作田，间隔10—15天再喷1次。旺长期叶面喷雾1次20%病毒A可溶性粉剂，预防病毒病。初果期发现细菌性斑点病，及时用72%农用链霉素可湿性粉剂500倍液喷雾防治。重病田或大棚，间隔10天喷1次，连续2—3次。
