病菌可随病株残体在土壤中越冬，翌年通过雨水、灌溉水及昆虫传播，多从根部或茎部的皮孔或伤口侵入。地温是发病的重要条件，当土壤温度达到20°C〜25°C、气温为30°C〜37°C时，田间易出现发病高峰。该病害多发于连作田和地下水位高、湿度大的冲积土田。应及时消毒和更换床土，并且有计划地进行轮作，同时，采用嫁接栽培方式加以防范。一旦发现病株，应立即剔除并烧毁。
青枯病是土壤传播的一类细菌性病害，病菌的主要侵入途径是通过作物根部的伤口侵染。病菌侵入作物后进入维管束，并通过增殖堵塞输导系统，使水分不能进入茎叶而引起青枯。病菌一经进入维管束，就很难清除，因此，生产上防治青枯病，预防是关键。
辣椒属于茄科植物，全科植物不能重复栽培，必须采取轮作。茄科的病害主要是土传和种子传播，随着水传播，传播以后很难治好，影响产量非常大，所以要注重防治和轮作。
1.提前播种。青枯病一般6月上中旬发生，为了避免发病高峰期与结果盛期相遇，可提早播种。
2.土壤消毒，保温保墒。土壤深翻后喷洒新高脂膜800倍液，给土壤消毒，保温保墒，有利于种子萌芽生长。
当土壤温度达到20℃时，出现发病中心，25℃时出现发病高峰。久雨或大雨后转晴，气温急剧升高，病情加重。一般情况病菌主要随病残体在土中越冬。开年春越冬病菌借助雨水、灌溉水传播，从伤口侵入，经过较长时间的潜伏和繁殖，至成株期遇高温高湿条件，向上扩展，在维管束的导管内繁殖，以致堵塞导管或细胞中毒，致使叶片萎蔫。
