落叶型(光秆型):病株叶片叶脉间或叶缘处突然出现褪绿萎蔫状,病叶由浅黄色迅速变为黄褐色,病株主茎顶梢侧枝顶端变褐枯死,病铃、苞叶变褐干枯,蕾、花、铃大量脱落,仅经10天左右病株成为光秆,纵剖病茎维管束变成黄褐色,严重的延续到植株顶部。枯斑型(掌状枯斑型):叶片症状为局部枯斑或掌状枯斑,枯死后脱落。黄斑型:叶片出现黄色斑块,后扩展为掌状黄条斑,叶片不脱落。在久旱高温之后,遇暴雨或大水漫灌,叶部尚未出现症状,植株就突然萎蔫,叶片迅速脱落,棉株成为光秆,剖开病茎可见维管束变成淡褐色,这是棉花黄萎病的急性型症状。该病不矮缩,能结少量棉铃。有时棉花黄萎病和棉花枯萎病混合发生,两种症状在同一棉株上显现。棉花黄萎病、棉花枯萎病都引致维管束变色。棉花黄萎病变色较浅,多呈黄褐色;枯萎病颜色较深,多呈黑褐色或黑色。发病重的棉株茎秆、枝条、叶柄的维管束全都变色。