拌种或浸种时，不能使用铁、铝等金属器皿，防止钼肥发生沉淀，最好在塑料薄膜上或瓷盆中进行。用钼肥拌种或浸过的种子有一定的毒性，人、畜不能食用，最好是播多少，拌多少，以免造成浪费。叶面喷施应选择晴天下午4时以后或上午9时以前喷施较好，风雨天或正午不宜喷施，以增强喷施效果。
磷对大豆根瘤生长发育和固氮的作用很重要，磷不仅促进根系生长，而且有利于根瘤的发育和提高根瘤的固氮能力。所以在豆科作物上，要重视施用磷肥，通过施磷肥促进固氮，可以达到“以磷增氮”的效果。生产上可将钼肥与磷肥配合喷施，效果很好。方法是：在每亩喷施的钼酸铵溶液中加30克磷酸铵，搅拌均匀即可使用，或钼肥与磷酸二氢钾混喷，一般在50公斤配好的钼酸铵溶液中，加入磷酸二氢钾100～150克即可。
钼肥虽然重要，但属微量元素，且钼在土壤中不易淋溶流失，在施钼过量或经常施钼的土壤中，容易造成钼素积累，时间长了会使大豆植株发生钼中毒现象。因此施钼不能过量，也不要在同一田里连年施用。
