大豆的病虫害种类较多，常见的病害有霜霉病、猝倒病、立枯病、紫斑病、叶斑病、褐斑病、灰霉病、灰斑病、细菌性斑点病、羞萎病、黑点病、锈病、灰星病、菌核病、病毒病、轮纹病、炭疽病、纹枯病、荚枯病、花叶病、根腐病、茎枯病、黑痘病、褐纹病、胞囊线虫病等。虫害有豆荚螟、大豆食心虫、豆天蛾、大豆造桥虫、青虫、蚜虫、棉铃虫、肾毒蛾、都天蛾、烟粉虱、卷叶螟、椿象、豆粉蝶、点蜂缘蝽、豆秆黑潜蝇、跳甲、盲蝽蟓、象鼻虫、大豆潜根蝇、蛴螬、象甲虫、苜蓿盲蝽、三点盲蝽、牧草缘蝽、斑须蝽、点峰缘蝽、大豆蚜、大青叶蝉等。
大豆种植管理中需要预防的病虫害主要有猝倒病、立枯病、紫斑病、叶斑病、褐斑病、灰霉病、灰斑病、锈病、荚枯病、病毒病、轮纹病、炭疽病、包囊线虫病、蚜虫、蛴螬、食心虫、象甲、盲蝽、苜蓿盲椿。合理田间管理是大豆管理的最后环节。在整个生长过程中应注意及时清除杂草，保持土壤湿度和通风透气，并根据气温、降雨和土壤的不同情况，采取不同的管理措施，以提高产量和品质。大豆种植中需要注意根腐病、大豆胞囊线虫病、菌核病、霜霉病、地下害虫、大豆食心虫、大豆蚜、斑鞘豆叶甲、苜蓿夜蛾。
