多年连作重茬地、排水不良低洼地及种植密度过大，氮肥施用过多，或苗期低温多雨，成株期高温多雨，虫害严重的地块均易发生黄萎病。病菌以菌丝、孢子随病残体在土壤中越冬，成为翌年的侵染源，在土壤中能存活6年以上，借风雨、流水、人畜和农具等传播。病菌从根部的伤口或直接从根系表皮和根毛侵入，在维管束内繁殖，并发展到枝叶。该病主要发生在成株期，低洼地、种植密度大易发病。温度在22℃左右且降水量较大时，有利于该病的发生和蔓延，此时正值向日葵现蕾期，需做好防治工作。重茬年限越长发病越重，春播向日葵比夏播的发病重。病菌在土壤、病残体和种子中越冬，种子果皮带菌，胚和胚乳不带菌。播种后病菌从伤口或幼根直接侵入发病，潜育期一般为7天。病菌生长温度范围为10～33℃，以23℃最适。