向日葵主要虫害有：金针虫、蛴螬、地老虎、草地螟、金龟子、向日葵螟、蚜虫、棉铃虫等。地下害虫可用氧化乐果配制毒饵除治。草地螟、金龟子危害茎叶，可喷氟矽酸钠。若危害种仁可在管状花序凋谢时用氧化乐果喷花盘。
向日葵主要病害有：锈病、菌核病、列当、霜霉病、褐斑病、枯黄萎病。锈病从幼苗到成熟均能危害，防治办法一般选用抗病品种、轮作、增施钾肥或用25%的萎锈灵2000倍液进行茎叶处理。
可以采用以下方法预防：
1.因地制宜选育和推广种植抗病品种。
2.轮作倒茬。提倡与非寄主植物实行轮作3年以上，减少侵染源。
3.加强田间管理。科学施肥，合理施氮、磷、钾肥，提高植株抗病力；合理灌溉，雨后注意排水；收获后及时清除病残体，带出田外集中处理。
4.药剂防治。发病初期及时对症用药治疗。