年度间春、夏、秋季温度偏高、多雨、结露时间长的年份发病重;田块间连作地、地势低洼、排水不良的田块发病较重;栽培上有机肥不足、播种过早、病虫害严重,均易诱发萝卜黑腐病发生。萝卜黑腐病发病的适宜温度为25℃~30℃,高温多雨、连作或早播、地势低洼、灌水过量、排水不良、肥料少或施用未腐熟的有机肥及人为伤口和虫伤多时发病重。病菌在种子或土壤里及病残体上越冬。播种带菌种子,幼芽在土壤中即可染病,致幼苗不能出土,有的虽能出土,但出苗后不久即死亡。在田间通过灌溉水、雨水及虫伤或农事操作造成的伤口传播蔓延。病菌从叶缘处水孔或叶面伤口侵人,先侵害少数薄壁细胞,后进入维管束向上下扩展,形成系统侵染。种株发病可使种子表面带菌,带菌种子成为此病远距离传播的主要途径。