番茄青枯病的侵染源是假单胞杆菌。这是一种细菌，能够在土壤中存活，并通过根部或茎部的伤口侵入番茄植株。该细菌可在维管束内繁殖，使维管束变褐腐烂，导致植株萎蔫。青枯病是一种典型的土传性病害，在中国南方各地都有发生，田块间连作地、地势低洼、排水不良、土质偏酸的田块发病较重。青枯菌通过寄主根的机械损伤部位侵染寄主植物的根，在无机械损伤时，侧根是青枯菌繁殖和侵入的优先位点，青枯菌的传染是从根部向顶部逐渐扩散的。感染青枯菌后，致病菌株侵染原生木质部导管降解细胞壁，约25%的木质部导管定殖足以引起番茄植株的部分萎蔫。
病原细菌主要随病株残余组织遗留在田间越冬，在土壤的病残体上营腐生生活能存活14个月以上。在环境条件适宜时，病菌主要借雨水反溅和灌溉水传播，也可通过农事操作、家畜等传播途径，从寄主的根部或茎基部的伤口侵入，侵入后在维管束内繁殖，向上部蔓延扩展，使维管束变褐腐烂，茎、叶因缺乏水分的正常供应而产生萎蔫。
西红柿青枯病传播途径，病原菌主要是通过雨水、灌溉水、地下害虫、农事操作等方式传播。病菌主要随病残体留在田间越冬，成为该病主要初侵染源。该菌主要通过雨水和灌溉水传播，病果及带菌肥料也可带菌，病菌从根部或茎基部伤口侵入，在植株体内的维管束组织中扩展，造成导管堵塞及细胞中毒致叶片萎蔫。主要通过灌溉，土壤，地下害虫等方式传播。
