胡萝卜链格孢黑腐病主要为害肉质根、叶片、叶柄及茎。叶片上病斑暗褐色,严重时叶片枯死。叶柄上病斑长条状。茎上病斑多为梭形至长条形,边缘不明显。湿度大时病斑表面密生黑色霉层。肉质根上形成不规则形或圆形稍凹陷黑色斑,严重时深达内部,使肉质根变黑腐烂。