主要的症状是烂瓜，主要危害花和幼果。病菌先侵染萎蔫的花，致花变褐软腐，称为“花腐”。病菌从瓜蒂侵入后逐渐蔓延到幼果，被害果实从顶部向下腐烂。致病瓜外部变褐，病部可见白色茸毛蔓延于瓜毛之间，以后隐约可见绵毛状霉顶具灰白色至黑色头状物。在湿度大时，病性扩展快，干燥条件下，果实局部或半个果实变褐色至黑褐色，病瓜逐渐软化。
南瓜不同生育期氮、磷、钾的吸收特点是：氮在南瓜结果前期吸收缓慢，并逐渐增加，在南瓜果实膨大期开始吸收急剧增多；磷的吸收比较平稳；钾的吸收与氮吸收过程相似，但在南瓜果实膨大期吸收特别突出；钙的吸收在南瓜结果前期逐渐增加，吸收量与氮、钾相似，但后期吸收比氮、钾少；镁的吸收在南瓜结果前和结果期类似于磷，果实内种子发育时需要量增加，容易缺镁。据研究，每生产1000千克南瓜果实约需吸收氮4.5~5.2千克、磷1.6~1.8千克、钾5.3~6.0千克、钙4~6千克、镁1~3千克。南瓜对氮、钾的需要量大，其次是钙、磷、镁。
