赤霉病是真菌病害，主要侵染小麦的穗部，症状为穗腐。小麦开花至乳熟期，小穗颖片出现水渍状淡褐色斑点，逐渐扩展到全穗。气候潮湿时，感病小穗基部出现粉红色胶黏霉层，后期产生煤屑状黑色颗粒。红色霉层是病菌的分生孢子座和分生孢子，黑色颗粒是病菌的子囊壳。
苗腐由种子带菌或土壤中病残体侵染所致。先是芽变褐，然后根冠腐烂，轻者病苗黄瘦，重者死亡，枯死苗湿度大时产生粉红色霉状物。穗腐在小麦扬花时，小穗和颖片上产生水浸状浅褐色斑，逐渐扩大至整个小穗，小穗枯黄。湿度大时，病斑处产生粉红色胶状霉层，后期出现密集的蓝黑色小颗粒，籽粒干瘪并伴有白色至粉红色霉。小穗发病后扩展至穗轴，病部枯褐，形成枯白穗。
茎基腐自幼苗出土至成熟均可发生，麦株基部组织受害后变褐腐烂，致全株枯死。秆腐多发生在穗下第一、二节，初在叶鞘上出现水渍状褪绿斑，后扩展为淡褐色至红褐色不规则形斑或向茎内扩展。病情严重时，造成病部以上枯黄，有时不能抽穗或抽出枯黄穗。气候潮湿时病部可见粉红色霉层。
赤霉病危害小麦各个部位，一般发病部位出现水渍状淡褐色斑点，潮湿时扩展到全穗，湿度大时有粉红色胶黏霉层，后期产生煤屑状颗粒。主要引起苗枯、穗腐、茎基腐、秆腐和穗腐，从幼苗到抽穗都可受害，其中影响最严重的是穗腐。
