主要为害叶片，在叶片上形成圆形或近圆形病斑，发病初期病斑呈褐色，随病斑发展逐渐变为灰褐色，表面稍隆起，周缘有黄色晕圈，病斑中央有一个浅灰色中心，四周黑褐色，严重时病叶变黄脱落。茎部也会染病，症状与叶片类似。每隔15天喷药1次，连续喷3-4次。常用药剂有10%苯醚甲环唑1500倍液、38%恶霜嘧铜菌酯800-1000倍液、56%嘧菌酯百菌清600-800倍液；或3波度的石硫合剂+200倍五氯酚钠药液，药剂轮换喷施。
辣椒褐斑病可危害叶片、叶柄茎、花梗和果实，以叶片上病斑最为常见，可造成落叶。病斑圆形或椭圆形，灰色至灰褐色，病斑中央灰白色到浅灰色，边缘深褐色，有同心轮纹，或轮纹不明显。潮湿时，病斑中心形成一层灰褐色霉层。后期病斑中心坏死破裂。发病严重时叶片上布满病斑，叶片变黄脱落。落叶和花梗染病常导致畸形果和果实发育不良。果实上病斑呈圆形，周围褐色，中央灰色。
受害叶上病斑初为水渍状斑点，后变为褐色圆形或亚圆形病斑，中心灰白色，中心周围为灰褐色，最外圈为一较宽的暗褐色边缘，稍见轮纹；病情严重时，整个病斑连成不规则形大斑并引起落叶。果实病斑圆形，黄褐色，边缘褐色，微凹陷，生有黑霉。辣椒发生褐斑病以后果实就会慢慢的变成黑褐色，发病部位出现凹陷不规则的形状，后期就会发生霉变直至果实掉落。严重的时候，相邻的果实会同时发病，病斑的面积更大，已经延伸到果实内部发生溃乱，导致辣椒产量直线下滑。
